前言 数据非依赖性采集（Data-Independent Acquisition，DIA）是当前蛋白质组学中应用范围较广的定量方式。DIA扫描模式中，超高分辨质谱将一级质谱的质荷比范围分为若干窗口，快速地对特定质量范围内所有母离子进行碎裂并采集碎片离子。相比于传统的DDA方法，DIA定量有更好的重现性及准确性，DIA也更加适用于大队列定量蛋白质组学研究[1]。作为应用于大队列的定量蛋白质组学研究策略，拥有一个更高效更稳定的解析平台尤为重要。Orbitrap Exploris系列质谱是赛默飞世尔科...
讲座题目：基于质谱的结构特异N-糖蛋白质组学及在肿瘤N-糖蛋白质标志物发现中的应用 演讲嘉宾：田志新（同济大学化学科学与工程学院） 内容简介：随着带多种高效解离方法的高分辨高精度Orbitrap轨道阱质谱仪的发展，N-糖蛋白多肽骨架和N-连接糖部分选择性解离成为了可能；加之结构特异理论N-连接数据库的建立和生物信息学解析工具的研发，基于质谱的结构特异N-糖蛋白质组学得以快速发展并被广泛应用于肿瘤潜在N-糖蛋白标志物的发现。 点击图片（选择在新标签页中打开链接~），精彩回放即可开启！
栏目： “精彩文章集锦” 本栏目“精彩文章集锦”，每期聚焦一个主题，致力于挖掘分享本社区中与该主题相关的历史精选文章，助力广大老师用户一站式、快速、高效获取相关高分干货内容，为您的科研学术之路赋能创新！ 本期主题： “组学”第三弹 在“组学”干货合集第二弹中，我们分享了众多“组学”相关的原版精彩文章，收获了广大老师的如潮好评！ 在本期“组学”干货合集第三弹中，我们继续聚焦“组学”“蛋白质组学”“食品组 学”，为您分享中文板块中的往期的精选文章，包括“前沿赏析”“案例分享”“应 用指南”三大部分...
关键词:Orbitrap Eclipse， Real Time Search，FAIMS Pro， TMT标记定量，DIA定量分析 前言 TMT标记定量是蛋白质组学多重定量分析研究中使用最广泛、也是功能最强大的研究策略，有实验周期短、检测通量高、缺失值少等优点，目前TMT标记已经可以同时完成最多18个样品的定性定量。这项技术面临的主要挑战为，共隔离肽段的干扰和MS2谱图中共碎裂导致定量精度的折损。为了解决这一挑战，在Orbitrap Fusion和Orbitrap Fusion Lumos “三...
关键词：FAIMS Pro、单细胞蛋白组，MSpep search 前言 常规蛋白组学一般为基于细胞群体内的研究，因此不可避免地会将大量细胞内的信息平均化，已经越来越难以满足对生命功能更加深入探究的需要。从单细胞层面去了解细胞特征以及彼此之间的相互影响，可以为生物系统中细胞间的异质性提供更宝贵的信息，因此有着越来越大的迫切需求。 另外，一些样品量受限的样品，例如具有高活力和转移潜能的CTC细胞（循环肿瘤细胞），它们浓度极低且罕见，而这正是单细胞分析所擅长的领域。还有一些其它重要但样品量有限的样品...
关键词：Orbitrap Exploris 480，FAIMS-Pro， Label Free定量，TMT定量，快速深度分析 前言 全新一代Orbitrap Exploris™480是一个更紧凑更稳健的平台，分辨率提升至 4 8 万，扫描速度达 40Hz ，集结了LFQ、TMT、Surequant等一系列定量功能。Exploris 480与三合一系列中的Fusion Lumos及Eclipse有相同的离子源、接口，可完美结合FAIMS Pro（High-Field Asymmetric Wave...
关键词：血浆，蛋白质组学，生物标志物，精准医学 前言 血液是最重要的临床检验样品来源。基于质谱的蛋白质组学可在几小时内定量几百个血浆蛋白，是研究血液生物标志物的主要方法之一。但由于血浆蛋白的动态范围极高，从血浆中鉴定蛋白的数量通常比较有限（200-300种），进行深度蛋白解析（>500种蛋白）往往还需进行繁琐的分级，影响了研究的通量和重现性。因此，我们利用Orbitrap Fusion Lumos质谱极佳的灵敏度和稳定性，发展了一种快速、稳定的高通量血浆蛋白质组研究策略。去除血浆中的高丰度蛋白后...
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