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推陈出新 | Proteome Discoverer™ 软件3.0版本重磅发布

推陈出新 Proteome Discoverer (PD)是一款针对蛋白质进行高通量定性、定量分析的软件。自2008年发布以来,PD软件不断在更新中进步,受到了广大用户的认可(图1,PD软件Publication概况)。 图1 Proteome Discoverer Publication概况(点击查看大图) 作为一款开拓创新的软件,PD软件目前已重磅推出3.0版本!PD 3.0版本中增加了全新的智能搜索引擎CHIMERYS™,这种全新的CHIMERYS™搜索算法是赛默飞与蛋白质组学人工智能领域...

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Orbitrap Fusion Lumos实现蛋白质组的快速深度分析

关键词:Orbitrap Fusion Lumos,Easy-nLC 1200,Label free定量/TMT标记定量,快速深度分析 1.前言 近年来,生物质谱技术不断创新,仪器性能也不断完善;从单一质量分析器质谱到双质量分析器的串联质谱,再到2013年赛默飞推出世界上第一款“三合一”质谱Orbitrap Fusion。Orbitrap Fusion集结了四级杆的高选择性和宽动态范围,静电场轨道阱的超高分辨率和超高质量精度,以及线性离子阱的多级质谱分析性能,可以满足从定性到定量,再到结构解析等...

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对不同规格商品化纳升预柱、分析柱评测

关键词:Orbitrap Fusion Lumos,Q Exactive HF-X,U3000 RSLCnano,纳升液相色谱柱 前言 蛋白质组学是对蛋白质的结构和功能的大规模研究。目前,基于质谱的方法已经被广泛地应用于蛋白质组学中。在目前的蛋白质组学分析策略中,主要采用纳升级液相色谱,为蛋白质组学研究用户提供更高的灵敏度,而且可以更轻松地与质谱连接, 同时还大幅降低了样品和溶剂的消耗量。这不但补偿了延长的操作时间,还降低了操作成本。为了获得高质量的原始数据,不仅需要超高分辨、超高灵敏度、超高质...

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Orbitrap Exploris平台FAIMS-DIA蛋白质组学快速定量分析

关键词:Orbitrap Exploris 480,FAIMS Pro,DIA,定量蛋白质组学 前言 数据非依赖性采集(Data-Independent Acquisition,DIA)是当前蛋白质组学中应用范围较广的定量方式。DIA扫描模式中,超高分辨质谱将一级质谱的质荷比范围分为若干窗口,快速地对特定质量范围内所有母离子进行碎裂并采集碎片离子。相比于传统的DDA方法,DIA定量有更好的重现性及准确性,DIA也更加适用于大队列定量蛋白质组学研究[1]。 作为应用于大队列的定量蛋白质组学研究策略...

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GC-Orbitrap/MS结合高分辨代谢物数据库在合成生物学非靶向代谢物分析的应用研究

关键词:代谢组学、合成生物学、 GC-Orbitrap/MS、 RBS-promotor、多元统计、高分辨率高质量精度(HRAM) 目标 本文应用非靶向代谢组学阐释了在不同生长条件下,诱导剂类型和浓度对工程菌代谢指纹谱图的影响。 简介 制药、农业以及加工制造业对特种化合物的巨大需求,一直是现代化学工业面临的巨大挑战之一。而现代化学工业需要在日益严格的监管审查情况下,不得不提出环境友好型的生产方法。由合成生物学和科技驱动的生物技术方法被认为是有潜力能够提供必要的持续解决方案。合成生物学的核心是将“...

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采用QExactive Plus建立生物体内408种氨基代谢物及脂质靶标代谢组学分析方法

关键词:Q Exactive plus,靶标代谢组学,神经递质,氨基酸,生物胺,脂质,酰基肉碱 摘要 氨基酸、生物胺、酰基肉碱和脂类物质是体内重要的代谢物,涉及多种代谢途径,和细胞凋亡、氧化应激、免疫功能、信号转导等生物学功能密切相关,是生命科学和临床上研究的重点领域。本文建立了采用异硫氰酸苯酯作为衍生化试剂进行衍生,408种内源性氨基酸、生物胺、酰基肉碱及脂类物质的靶标代谢组学分析方法。结果表明:41种氨基酸和生物胺类代谢物线性及重现性良好,标准曲线浓度为0.025~2000 μ mol范围内...

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全新一代超高分辨质谱Orbitrap Exploris 240 在代谢组学和脂质组学中的应用

关键词:Exploris 240,非靶标代谢组学,脂质组学,代谢流,AcquireX 前言 代谢组学和脂质组学技术是近年来发展发展迅猛的一门学科,在疾病生理病理相关过程,生物标志物和机制探索中具有良好的应用前景,并逐渐在多个领域得到广泛的应用。如疾病研究、食品营养、环境毒理、植物等与人类健康护理密切相关的领域[1-7]。 代谢组学因其样本的高度复杂性和代谢物的多样性,在研究中遇到诸多的需求和挑战。特别是更高的代谢物组覆盖率,更高的灵敏度、大队列研究中的稳定性和重现性,对仪器分析提出了非常高的要求...

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