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代谢组学 | GC-Orbitrap/MS—— 小分子识别定量必备

原创 飞飞 赛默飞色谱与质谱中国 关注我们,更多干货和惊喜好礼 李丕 邢江涛 代谢组学旨在对给定生物学背景下的所有代谢物(小分子)进行识别和定量。质谱法是对小分子进行准确分析的最强大工具之一,可以检测成百上千种代谢物。然而,由于数据库覆盖范围有限及代谢组的复杂性,通常只有不到30%的化合物被鉴定,而未注释的峰很可能是感兴趣化合物。因此未知物识别一直是代谢组学研究中最耗时的步骤,依赖质谱专家对数据进行劳动密集型的手动注释。 本文将从分辨率和质量精度、同位素过滤、CI确认、灵敏度、动态范围、解析软件...

TianyiZhang_0-1678954911409.jpeg TianyiZhang_1-1678954911554.jpeg TianyiZhang_2-1678954911460.png TianyiZhang_3-1678954911368.png

代谢组学 | GC-Orbitrap/MS—— 小分子识别定量必备

原创 飞飞 赛默飞色谱与质谱中国 关注我们,更多干货和惊喜好礼 李丕 邢江涛 代谢组学旨在对给定生物学背景下的所有代谢物(小分子)进行识别和定量。质谱法是对小分子进行准确分析的最强大工具之一,可以检测成百上千种代谢物。然而,由于数据库覆盖范围有限及代谢组的复杂性,通常只有不到30%的化合物被鉴定,而未注释的峰很可能是感兴趣化合物。因此未知物识别一直是代谢组学研究中最耗时的步骤,依赖质谱专家对数据进行劳动密集型的手动注释。 本文将从分辨率和质量精度、同位素过滤、CI确认、灵敏度、动态范围、解析软件...

TianyiZhang_0-1680231338133.jpeg TianyiZhang_1-1680231338114.jpeg TianyiZhang_2-1680231338272.png TianyiZhang_3-1680231341049.png

全新一代Orbitrap Exploris120在代谢流中的应用

关键词:Orbitrap Exploris 120,Compound Discoverer,代谢流 前言 正常细胞的生命活动由功能基因、蛋白质、以及小分子代谢物来共同承担,代谢物处于基因调控网络的最下游,在维持机体的正常生理功能过程发挥着重要的作用。近年来,随着技术的发展,代谢组学已逐渐显现出在疾病生理病理相关过程、生物标志物、机制探索以及新的治疗靶点研究中得到广泛的应用,成为生命科学领域研究不可或缺的技术手段之一。 然而,机体的代谢网络往往高度复杂且动态变化的。因此,我们无法以代谢物的含量高低...

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全新一代超高分辨质谱Orbitrap Exploris 120 在代谢组学和脂质组学中的应用

关键词Exploris 120,非靶标代谢组学,脂质组学,代谢流,Mild Trapping 前言 代谢组学和脂质组学技术是近年来发展发展迅猛的一门学科,在疾病生理病理相关过程,生物标志物和机制探索中具有良好的应用前景,并逐渐在多个领域得到广泛的应用,如疾病研究、食品营养、环境毒理、植物等与人类健康护理密切相关的领域[1-7]。 代谢组学因其样本的高度复杂性和代谢物的多样性,在研究中遇到诸多的需求和挑战。特别是更高的代谢物组覆盖率,更高的灵敏度、大队列研究中的稳定性和重现性,对仪器分析提出了非常...

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基于Orbitrap ID-X Tribrid MS以及TSQ Quantis的拟靶标代谢组学分析

关键词:拟靶标代谢组学,Orbitrap ID-X ,Compound Discoverer ,TSQ Quantis 前言 在生命科学奇妙世界里,基因、核酸、蛋白和小分子代谢产物构成了细胞生命活动的基本要素,以这些物质为基础的诸多组学技术的发展,推动着生命科学研究不断向前。代谢组学(Metabonomics/Metabolomics) 是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究生命体 (包括植物) 被扰动后(如基因的改变,环境的变化)其内源性代谢物组种类、数量及其变化规律的科学[1]...

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采用全新一代三重四级杆液质联用仪:建立生物体内41种氨基酸和生物胺类靶标代谢组学分析方法

关键词:TSQ Altis,靶标代谢组学,神经递质,氨基酸,生物胺 摘要 氨基酸及生物胺类物质是体内重要的代谢物,涉及多种代谢途径,和中枢系统、胰岛素抵抗、氧化应激、免疫系统等疾病密切相关,是生命科学和临床上研究的重点领域。本文建立了41种内源性氨基酸和生物胺类物质的靶标代谢组学分析方法,采用异硫氰酸苯酯作为衍生化试剂进行衍生,以0.2%FA的乙腈和H2O为流动相,结果表明:TSQ Altis 测定41种代谢物线性及重现性良好,R2>0.99;灵敏度极佳,柱上LOD低至0.002~8.3fmol...

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精彩文章集锦 | “组学”干货合集第二弹,与您共享“蛋白质组学”“代谢组学”精选高分文章

栏目: “精彩文章集锦” 本栏目“精彩文章集锦”,每期聚焦一个主题,致力于挖掘分享本社区中与该主题相关的历史精选文章,助力广大老师用户一站式、快速、高效获取相关高分干货内容,为您的科研学术之路赋能创新! 本期主题: “组学”第二弹 在“组学”干货合集第一弹中,我们分享了众多“组学”相关的原版精彩文章,收获了广大老师的如潮好评! 在本期“组学”干货合集第二弹中,我们继续聚焦“组学”“蛋白质组学”“代谢组学”,为您分享中文板块中的往期的精选文章,包括“前沿赏析”“案例分享”“应用指南”三大部分,助您...

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