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赛默飞/蛋白质组学生态系统

 

作为后基因组时代的重要组成部分,蛋白质组学经过二十几年的发展,已经逐渐走向成熟。蛋白质组学流程复杂,有较高的操作和实验技能的要求。其完整的实验步骤一般包括实验设计、样品前处理(蛋白提取、定量、酶解、脱盐等)、LC-MS/MS分析、数据库检索、生物信息学分析等多重步骤,而针对蛋白质组学步骤中繁琐耗时或者实验的稳定性、通量等用户的关注热点,赛默飞推出全新的为所有的蛋白质组学用户量身打造的一站式工作流,以满足用户对高通量定性定量蛋白质组学的全部需求。

1.png△图1:满足高通量定性定量蛋白质组学需求的一站式工作流(点击查看大图)

 

赛默飞AccelerOme自动化样品前处理平台

在蛋白质组学中,最为困扰大家的当属样品样品的前处理制备过程,样品制备过程繁琐、耗时,欠缺标准化的处理步骤使得蛋白质组学在不同的操作人员、不同的实验室之间重复性较差。针对这个痛点,赛默飞推出了全新的全自动的蛋白质组学样品制备平台AccelerOme(如图2)。2.png

△图2:全自动的蛋白质组学样品制备平台(点击查看大图)

 

AccelerOme可完成蛋白样品的还原烷基化、酶解、TMT标记、脱盐、多肽定量等多步操作(如图3),其具有强大的鲁棒性的硬件,搭配现成的预配置的试剂以及直观的端到端软件,使标准化的蛋白质组学制备流程走进万千实验室,解放双手。

3.png△图3:AccelerOme自动化样品前处理平台在蛋白质组学全流程中的作用(点击查看大图)

 

其中,AccelerOme的强大的适配软件,支持使用者们从实验设计到数据分析的全流程。在蛋白质组学以及生物制药的HCP、药代动力学实验中,可帮助实验人员更加简便快速的获得高质量的、可重复的样品。

 

全新的μPAC™Neo HPLC色谱柱

在LC-MS/MS检测中,我们希望低流速的纳升液相能够提供更加稳健的表现和更高的日均检测通量。为此,赛默飞于去年发布了全新的低流速液相Vanquish Neo,与之相匹配的,这次我们推出了全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色谱柱。

全新色谱柱优势

 

★与普通的填充柱不同,全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色谱柱为微柱蚀刻技术,不同的色谱柱一致性强;

 

★同时低背压设计,50cm色谱柱,300nl/min流速下,背压仅110-150 bar;

 

★还可灵活适配于不同的工作流程,其可适配15-120min色谱梯度及5-500ng大范围的上样量。

 

全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色谱柱,在具有极其出色的性能的同时,兼具高度的鲁棒性及更长的使用寿命(如图4)。

4.png△图4:全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色谱柱多针上样结果(从2月开始使用,间隔进行QC测试,共进行近500针QC测试)

(点击查看大图)

 

Proteome Discoverer™3.0软件搭配CHIMERYS™搜索引擎

好马配好鞍,除了前述的全新的自动化样品前处理平台、全新的色谱柱以及性能及其出色的Vanquish Neo低流速色谱仪和Orbitrap系列质谱仪器,本次全新一站式蛋白质组学工作流,还将推出升级版软件Proteome Discoverer™ 3.0以及全新的智能搜索引擎CHIMERYS™。全新的CHIMERYS搜索算法是赛默飞与蛋白质组学人工智能领域的领导者MSAID™合作的全新一代为解析混合谱而设计的人工智能算法,这种革命性的算法可以大大提升DDA数据中被识别的PSMs数,从而实现在鉴定数目上的性能断层的巨大飞跃。

5.png△图5:CHIMERYS搜索引擎可以在复杂的混合谱中识别出更多的PSMs(点击查看大图)

 

6.png△图6:与前代软件相比,CHIMERYS搜索引擎在鉴定量上带来性能断层的飞跃(点击查看大图)

 

CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段与蛋白的鉴定、非标记定量(LFQ)、TMT(包括TMT Pro)标记的定性与定量需求,未来也将支持翻译后修饰等需求。

 

结语
赛默飞全新一站式工作流,为蛋白质组学用户量身打造,可满足用户对高通量定性定量蛋白质组学的全部需求。赛默飞与各位科学工作者们一起,在蛋白质组学的领域里,扬帆起航,乘风破浪!

 

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@dongdan 

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